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miRNA/ circRNA/ LncRNA 相关调控分子机制研究


服务简介: miRNAmRNA的调控机制,是通过靶向互补 mRNAs导致目的mRNA降解或翻译抑制,参与调节其下游基因翻译过程,从而发挥其生物学功能circRNA在细胞中一般可扮演两个角色,一方面是作为ceRNA吸附miRNA,从而调控靶基因的转录;一方面可以和蛋白互作而参与调控蛋白的稳定性或者其他功能LncRNA也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA,从而调节调节mRNA水平,也就是发挥ceRNA的作用。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。综上,我们可以搭建circRNA-miRNA-mRNA或者LncRNA-miRNA-mRNA的网络,来研究miRNA/circRNA/LncRNA的功能。

 

常用研究方法:

(1) 选取几对样本进行全转录组测序,筛选到感兴趣的分子

(2) 在线数据分析,获得目标分子

(3) 双荧光素酶实验:用于验证circRNA或者LncRNA是否可以作为ceRNA吸附mRNA;还可  以验证miRNA是否对mRNA有靶定作用

(4) Anti-AGO2 RIP可以同时捕捉到miRNA和circRNA/LncRNA

(5) RNA Pull-down实验可以检测circRNA/LncRNA是否可以吸附miRNA

(6) 采用RNA pulldown及Mass技术分析,获取circRNA/LncRNA互作的蛋白,按照互作蛋白网络构建流程,绘制互作蛋白网络。选取感兴趣的进行后续研究

 (7) FISH共定位分析

 (8) 定量PCR检测

 (9) Western blot检测miRNA/circRNA或者miRNA/LncRNA的表达丰度的改变是否会影响下游靶mRNA的蛋白水平

 (10) 动物实验

 

服务流程:

(1) 确定待研究的目的分子

(2) 细胞验证

(3) 动物体内验证

 

说明:

(1) 服务周期:视具体服务项目而定

(2) 如提供组织:干冰邮寄,大于0.1mg

(3) 如提供细胞: 常温邮寄活细胞1瓶(T25),瓶内充满完全培养基

 

费用标准: 询价

 

交付结果:

(1) 原始实验图片及数据

(2) 具体试验流程(包括实验步骤、主要仪器及试剂说明等)